魔法学園《アストリア》で、魔力と適性が極端に低いとされる落ちこぼれの少女・リアは、クラスメイトから陰湿ないじめを受け続け、孤独な日々を送っていた。 ある日の必修科目「召喚の儀」で、リアは偶然にも異世界の大魔導士・シオンを召喚してしまう。人型の高位存在が召喚されたことで学園は大騒ぎとなり、特にクラスの中心人物であるヴィオラとその取り巻きカミラ、リリアは、リアの存在を脅威とみなす。 シオンはリアの傍に留まることを選び、彼女の魔法指導を始める。表向きは友好的な態度を取るヴィオラだったが、裏ではリアへのいじめをさらにエスカレートさせていく。しかしシオンの存在がそれを許さない。 シオンはリアの内に秘められた「異質で強大な魔力」の可能性を見抜き、基礎から丁寧に指導する。リアはこれまで誰も認めてくれなかった自分の才能を初めて信じられるようになり、驚異的な学習速度で魔法を習得していく。 やがて戦闘魔法学教授バルドがシオンの規格外の力量を認め、彼を特別講師として招聘。シオンは学園の結界を単独で強化・魔力遮断機能を追加するなど、その圧倒的な実力を発揮する。 一方、ヴィオラはシオンとリアの関係を深く警戒し、陰でより狡猾な策略を巡らせ始める。いじめは精神的・肉体的なものから、魔術的な嫌がらせへと変化していき、リアの心を何度も折ろうとする。 しかしシオンの温かくも厳しい指導と、初めて得た「守られる」感覚により、リアは少しずつ強くなっていく。そしてある事件をきっかけに、彼女の内に眠っていた「真の魔力」が覚醒の兆しを見せ始める――。