舞咲市に暮らすごく普通の女子高生、桃瀬愛未。 彼女には誰にも言えない秘密がある。 世界征服を狙う悪の組織“ダーク・オーダーズ”と戦う、たった一人の魔法少女“ピンク☆ラブリー”なのだ。 天然で頼りないながらも心優しい天才科学者・黒埼博士に恋をしながら、どこか間の抜けたしたっぱたちや、「貴様は私に恋をしている！」と勝手に両想いを宣言する悪の総帥“シャドウ・マスク”に今日も振り回される。 今日も舞咲市は平和です。 ……そう、誰もが思っていた。 少女の笑顔も、涙も、恋心も。
そのすべては、ある一人の男によって静かに観測されていた。 これは、ご当地魔法少女ラブコメディ。 
そして、一人の少女の恋心が“上書き（オーバーライド）”されるまでの物語。