現実世界の武術に限界を感じていた高校生・美凪ハルは、ハルモニア魔法学園の少女メルシア・サフィラスに守護獣として召喚される。 本来なら獣の姿をした守護獣が現れるはずの場で、メルが呼び出したのは人間の少年ハル。学園中がざわめく中、二人の奇妙な契約が始まる。 メルは有属性魔法が使えず、無属性魔法しか扱えない。そのせいで魔法学園では評価されず、かつての親友ルーチェからも退学を迫られていた。 だがハルは、基礎魔法「魔力弾」に可能性を見出す。武術で培った修行理論を魔法に応用し、メルと共に修行を始める...