高校一年生の朝比奈凛は、学校帰りに「人間の世界と魔法の世界の境目」にある不思議な図書館へ迷い込む。そこで出会った少女司書・栞と過ごすうちに、凛は未来は決まったものではなく、自分の選択で変えられることを知る。やがて栞の隠された使命が明らかになり、二人の出会いが魔法世界の未来を変える、小さな奇跡の物語が始まる。