2034年、日本。生活基盤、インフラ、街中を突然に謎の水が覆い、人々の日常を豹変させた「Styx(ステュクス)の悲劇」から6年。世界は何事も無かったかのように回り始めているが、その日々に未知の影が近づいていた───。高校入学したての春、クラスに馴染めず友達も作れずにいた貞廣天(さだひろあまて)は、ある日の学校帰りに危険とされる未確認水没地域「USR」に近づいてしまい、謎の生物に遭遇。危ういところで「Ariel(アリエル)」と名乗る謎の少女に助けられる。「USRには化け物が存在する」と言う彼女と共に、水没の謎、隠された真実を解き明かす。