人間の畏怖や慈しみが神格という災厄へと変貌を遂げる世界。神格を見定め境界を引く『神格鑑定局』において、九条湊は主観を排して事実のみを書き残す無力の「記録官」に過ぎなかった。彼の心の奥底には、十年前に神格災害へと巻き込まれ、存在そのものを抹消された妹・澪の影が落ちている。 ある日、人々の死を静かに看取る『迎えの神』の調査に赴いた湊は、忘れ去られた過去の犠牲者の真実を突き止め、名前を与えることで神格の呪いを解き明かす。 さらにその裏で浮上する、局によって黒塗りされた妹の過去。世界を平穏に保つための都合の良い忘却に対し、湊は一本の万年筆を手に、忘れ去られた者たちの生きた証を刻む戦いに挑む。