魔力を制御して操る機関“魔統”を育てる魔法界の名門校〈魔法学園リブラリス〉。 そこでは、魔法の闇によって生まれる数々の“異形”たちを討伐する生徒の育成も同時に行われていた。 主人公とその仲間たちは、学園内で次々と起こる異形侵入と、そこに隠された謎を紐解いていく───……。