遠い昔、この世界では魔族と女神族の対立が激化していた。 終わりの見えない戦いに業を煮やした両陣営は、その決着を未来へ託すことを決める。 それから三百年前――。 突如として魔王と女神が世界に姿を現した。 彼らは眠っていた力を呼び覚まし、それまで自らの出自を知らずに生きてきた人々を、魔族、女神族、そして混血へと分かち、それぞれに失われていた一族の誇りと記憶を与えた。 やがて人々は種族ごとに土地を分け、ときには争いを繰り返しながら生きるようになる。 日本では混血種への攻撃を禁じる掟のもと、中部地方を混血の居住地とし、東を魔族、西を女神族が治めていた。 高校進学以前の記憶を失った混血の少年・蓮也もまた、その中部地方で平穏な日々を送っていた。 しかし、本来ならばどちらの争いにも巻き込まれないはずだった彼は、魔族と女神族の未来を懸けた「聖戦」へと足を踏み入れることになる――。