幼い頃に母親が行方不明になってしまった主人公は、ある日怪しげな男から「母親は生きている」と告げられる。男に連れられてアヤカシの世界に来た主人公は、自身に宿る巫女の力と母の秘密、そして妖狐族によるアヤカシ界と人間界の危機を知る。主人公は自身の力で母を救う為に、アヤカシたちの元で修行を開始した。 そこに妖狐族が現れ、仲間の死に直面した主人公は、自身の中に眠っていた力を発揮する。なんとかその場の危機は脱したものの、事態は悪くなっていく一方だった。そんな中でも主人公は急場しのぎで修行をしながら、やっとの思いで母親と再会を果たす。だがその頃には妖狐たちが強大な力を付けていた。 母が倒れたことで主人公は自身の力の制御を失い、人間界すら壊してしまいそうになる。しかし自身の闇を受け入れ、かつて助けた精霊たちの力も借りて、主人公は黒幕を打ち破ることに成功する。その黒幕の正体は……。