文明崩壊から三百年。人類は巨大な防壁都市で暮らし、危険な遺跡から旧文明の遺物を回収する「ハンター」として生計を立てていた。 十五歳の少年・黒鋼アラタは、ESP能力者とBD（バトルドレス）操縦者を育成する秘密研究機関の訓練生だった。成績は平均だったが、同期は機関史上最強の「天才世代」。その中で埋もれたアラタは「落ちこぼれ」と呼ばれ続けていた。 そんな彼には、唯一心を許せる同期の少女・レイン・ヴァイスハルトがいた。 ある日、二人は機関が不要になった訓練生を処分する計画を知り、それぞれ専用のBDで脱走を決意。追撃部隊を撃破し、BDの空間格納機能《ディメンション・ハンガー》で敵機を回収して防壁都市へ逃げ延びる。 売却したBDで得た資金を元手に二人は共同生活を始め、ハンター協会へ登録。遺跡を巡り、旧文明の遺物を求めて戦うハンターとして新たな人生を歩み始める。 これは、「落ちこぼれ」と呼ばれた少年と、彼を支え続ける少女が、自由と居場所を求めて未来を切り開くポストアポカリプスSFアクションである。