念動力が弱く、路上で芸をして暮らす少年・藤野蒼汰。ある日、彼の家に宇宙から少女がやってきた。名は星野花海。銀河安全協会の調査員だという。彼女をきっかけに、蒼汰は中二病の自称ヒーロー・神崎夜斗と出会い、怪物との戦いに巻き込まれていく。やがて彼らは銀河全体を脅かす「暗神」の存在を知る。三人は運命に立ち向かう——。