大学の敷地の最奥、取り壊しを待つだけの旧西棟に、学生たちの間で密かに『無菌室』と呼ばれる一室がある。 そこに君臨するのは、学生ピア・カウンセラーの鴻巣美青。彼女は、圧倒的な美しさと、血の通った感情を一切排除した冷徹な論理で、傷ついた学生たちの心を『解剖』し、再構築していく。彼女の言葉というメスに触れた者は、過去のトラウマという泥を剥ぎ取られ、瞬く間に従順で空虚な『綺麗な魚』へと作り変えられてしまうのだ。 サークルの一員である沙耶は、そんな美青という『聖なる虚無』に深く魅了されていた。沙耶は、自らの内に澱む醜い人間臭さを憎み、美青が創り出す絶対的な静寂と清潔さの中にこそ、唯一の救済があると信じ、彼女の作る水槽の一部になることを切望する。 しかし、この完璧に統御された閉鎖空間に、抗いがたい熱量を持つ異物・城ノ内咲夜が乱入する。 論理では捉えきれない、生そのもののような混沌を抱えた咲夜の存在は、美青が張り巡らせた絶対的な秩序に微細な亀裂を入れ、やがて水槽を粉砕するほどの激震をもたらしていく。 冷徹な偶像、狂信的な崇拝者、そして侵入する生の混沌。 透明なガラスの中で、人間という生き物の剥き出しの正体が暴かれていく。