遠い未来、遥か彼方の時代で目を覚ました男ーー桂木祐一。 記憶の欠落した男は、廃棄された移民船の中で、取り残された管理人格の少女と出会う。 彼女は言ったーー「ようこそ、恒星間移民船クレイドルへ、貴方を歓迎します。艦長(マスター)」 記憶を取り戻すため？　自身のルーツを探すため？　いや、何よりも、まずは生き残る為に――。 男の長く波乱に満ちた航海が始まる。