大学生の宮坂陸は、オカルト研究会の夏合宿で故郷・丹神村へ帰ることになった。 山奥にある小さな限界集落。 赤い花が咲く沼。 廃坑となった辰砂鉱山。 そして、「六赤様」の伝承。 子どもの頃、姉のように慕っていた少女・チカは、霧の中へ消えた。 誰も真相を語らず、村は「事故だった」と言い続けてきた。 だが、帰郷をきっかけに、封じられていた過去が少しずつ姿を現す。 因習と怪異、そして罪。 赤い花が咲く村で、封じられた過去が再び動き出す。