時は26年前の2001年9月11日、世界唯一の超大国だったアメリカに突如、異能生命体「アビリティア」が襲来して、アメリカは1日で国家崩壊して、世界のパワーバランスは急速に崩壊した。 「アビリティア」はシベリア帝国と大華帝国も傘下にいれて、翌2002年4月8日に日本を侵攻した。 大華帝国とシベリア帝国は異能人からの支援を受けて、現代の技術では実現できない異能兵器を使って、シベリア帝国に北海道を、大華帝国に沖縄、九州、広島を3日足らずで占領して、さらに戦闘開始から5日目の4月13日に当時の総理大臣大泉純太郎が謎の死を遂げて、4月15日に日本は北海道、広島、九州、沖縄を奪われてわずか1週間で終戦した。 その後、日本政府は国民全員に改良した1種類の能力しか使えない異能チップを埋め込むことと、7歳から日本異能軍に入隊することが義務化された。北海道と広島、九州、沖縄を奪還するために、 しかし、若者はみんな戦いたくなく、都市部にある支部は序列争いが原因で派閥争いが横行する激戦区になり、過疎部は人手不足という歪な形になってしまって、奪還作戦が全く進まない状況になってしまった。 そして時は2027年4月、これは大華帝国との占領地と面していて、常に危険と隣り合わせの弓島支部でレモンの果実や果汁を操る「檸檬操作(シトラスショット)」の能力者の16歳の少年弓原 湊とその幼馴染で海水の中の塩を操り、武器にすることができる「塩化変化(ソルティスパーク)」の能力者の同じ年の少女、潮見 玲の2人を中心とした弓島支部の物語----