世界には千のダンジョンが存在する。 すべてのダンジョンには順位があり、上位ほど豊かな資源と強力な魔物を得られる。 下位ダンジョンに待つのは衰退と消滅だけ。 そんな世界で、若きダンジョンマスターのアルベルト・クロイツが継承したのはランキング998位の『忘れられた洞窟』だった。 配下はゴブリン二匹とスライム三匹。 誰もが終わったダンジョンだと笑う。 しかしアルベルトは希少な天職【配合士】の持ち主だった。 魔物同士の相性と成功率を見抜く固有能力【配合眼】を武器に、雑魚モンスターを掛け合わせて新種を生み出していく。 やがて誕生するのは、図鑑にも存在しない魔物たち。 そして世界を揺るがす最強のダンジョン。 これは最弱998位から始まる、配合士の成り上がり物語。