2042年。 AIとアンドロイドが社会に溶け込んだ東京。 東京都庁・特別対策室に所属する秋元凛子は、かつて反乱アンドロイド対策に従事していた捜査官である。 恋人であり上司でもある田村智司、室長の高槻、天才ハッカーの飯島たちとともに、最新AI研究用チップを狙った襲撃事件の調査に乗り出した。 犯人は交通網をハッキングし、自律建機を暴走させ、痕跡を残さず姿を消す。 だが事件の後から、奇妙なことが起こり始める。 監視カメラがこちらを見ている。 街路灯に見知らぬメッセージが浮かぶ。 誰かが、自分たちを見ている。 そして狙われたのは、なぜか飯島だった。 東京を侵食する見えない何者かを追いながら、秋元たちは再び危険なチップ搬送任務に挑む。 しかしその頃にはもう、敵は彼らのすぐそばまで入り込んでいた――。