日本一の名門高校、英帝学園高等学校。 そこは全国で最も才の優れた学生30人のみが入学を許される神域。 一方的に合格通知を与えられた秋西光一（あきにし こういち）は、 自身がなぜ入学できたのか分からないまま、場違い感を胸に秘めて英帝での学園生活を始める。 そこではあらゆる成績や評価を総合した「才能ランク」が学生ごとに与えられ、 29位の光一は30位の夏樹颯太（なつき そうた）とともに落第候補の烙印を入学早々に押される。 ある日、職員室では教員の机が何者かに荒らされる事件が発生する。 落第候補の2人に容疑がかかるなか、退学処分を免れるために光一と颯太は犯人捜しに臨む。 犯人は誰なのか？そしてその目的は？ 日本一の名門校で発生した怪異の謎を解くため、退学危機の最下位コンビが奔走する！