新人分析官の犀川燈子は人事異動によって帝國第三図書館の臨時調査員に任命される。利用者がほとんどいないと言われるその図書館の蔵書はただの本ではなく、怪異を封じた本『封書』だった。蝙蝠が本性の司書 本守幸太朗と共に封書が起こす異変を解明する為、雨が降る街を舞台に怪異の物語の謎を紐解いていく。