天変地異により海面が上昇し、大半の陸地が海の下へ沈んでしまった世界。残った手狭な土地を奪い合う超ストレス社会と化した「都市」では時折、超常的な現象や生き物が目撃される。都市で生活する魔法学園の生徒、小鳥もまた身に降りかかった異常現象に頭を悩ませていた。そんな時、対異常用の治安維持組織の男と出会い―― 頻発するアノマリー事件に巻き込まれる内、都市の歪な構造に触れる事となる。本当に恐ろしいのはアノマリーか、或いは人なのか。