2026年、世界同時にダンジョンが出現し、現代社会は階層型迷宮攻略の時代へ突入する。主人公の一ノ瀬奏（いちのせ そう）・幼馴染の神門舞（みかど まい）・神楽旬（かぐら しゅん）・桜木百華（さくらぎ ももか）はそれぞれの想いを抱き、共に探索者となる。四人は互いを支えながら成長していく。やがてダンジョンの謎と世界最強勢力が交錯し、彼らは日本の運命を左右する戦いへ巻き込まれていく。