ある日の夜、主人公の女の子アリスが自分の部屋で眠りにつこうとしたとき、部屋の鏡の奥から必死に助けを求める声が聞こえてきた。 声の主は、鏡の向こう側にあるお菓子の国「メルヘンランド」。 平和だったメルヘンランドが、突然現れた「闇の女王」とその軍勢によって支配されてしまったという。 闇の女王は、メルヘンランドを暗黒の世界に変えようと、国のあちこちを「おかしな迷路」に変えてしまった。アリス最初の迷宮でミロンと出会う。彼の不思議なシャボン玉の力を授かり、鏡を通り抜けてメルヘンランドを救う冒険へと旅立つことになる。