硝石晶によって発展した世界、ヴィトラリス。 人々は十五歳になると「グラス・レーヴ」という儀式を行い、自らの心を分け与えて、生涯の相棒となるグラセルを生み出す。 しかし、少年リュド＝グラスフェルドは儀式に失敗し、ただ一人グラセルを持たずに生きていた。 そんな彼はある日、地下室で記憶を失ったガラスの少女ネリィと出会う。 彼女の身体は、奇跡の硝石晶――ルパーティアでできていた。 ネリィの失われた記憶。 ルパーティアに隠された謎。 そして、それを狙う組織。 心を宿せなかった少年と、記憶を失った少女の、魂と記憶を巡る冒険が始まる。