海底からそびえ立つ無数のコロニーで構成される3国。高度な技術が生み出した豊かな社会、しかしその裏には暗黙の階級制度が根を張っていた。理不尽な現実に燻りながらも、どこにもぶつけられない怒りを抱える少年ミカ。そんな彼の前に突如現れた謎の可変潜水機"Drefia"。深海の闇に眠っていた怒りは、やがて世界を揺るがす炎となって孵化する。