突如として異世界に召喚された平凡な高校生・相馬蓮（ソーマ）。しかし、彼に与えられた職業は戦闘力皆無の「デバッガー」だった。レベルもステータスも初期値から上がらない最弱の状況の中、蓮は自身にだけ世界の「バグ（エラーコード）」が見えることに気づく。壁抜け、アイテム増殖、ステータス改ざんなど、世界の物理法則を無視したバグ技を駆使することで、蓮は並み居る強敵やチート転生者たちを圧倒していく。やがて彼は、この世界が崩壊の危機に瀕しているシステムエラーの塊であることを知り、世界のシステムそのものを修正するための戦いに身を投じる。