高校生の日下部慎吾は、あるきっかけで死亡してしまう。目が覚めた時自分がいたのは、生前暮らしていた場所のようで、少し違う場所。「刀剣士」を名乗る愛川千鶴からその場所が「仮想空間」であると教えられた慎吾は、仮想空間を出て千鶴たちの暮らす「刀剣世界」に足を踏み入れることになる。 刀剣十番隊に入隊し、刀剣士となる慎吾。様々な隊員と出会い、成長していく。 ある時、転生者を受け入れる刀剣士集団「新革派」と受け入れない刀剣士集団「保守派」が毎年戦争をしていると聞き、慎吾も新米として戦うことになる。そこでは様々な刀剣士が慎吾を待ち受けていた。 さらに、敵対勢力の存在も判明する。慎吾たち刀剣士は、世界に完全な平和をもたらすために敵対勢力の全滅を目指す。