とある研究所から、一人と一匹が脱走した。記憶喪失の男、チャリと改造されたネズミ、アル。追っ手から逃げつつ、彼らは失われた記憶を求める旅に出る。手がかりを握る鍵、アップルチークタウンを目指して。