大学生の夏目ワタルは、友人と泊った温泉宿の窓から見えた山のなかで人が鍬で土らしきものを掘っている場面を見る。鍬には黄色のタオルのようなものが引っかかっていた。深夜だったので不気味さを感じたと同時に、直後セーラー服姿の女の子が部屋に現れすぐに消えた。そのときは、疲労と悩みから幻を見たと思い込む。帰宅後、実験に追われる研究生活を再開させるが、旅館で現れて消えた女の子ととてもよく似た女子高校生のマヒロが、アカデミックインターンシップを利用してワタルの研究室に現れる。