時は20XX年。 突如世界中へ現れた謎の存在【Noise】は、電子機器を狂わせ、人々の心に絶望を植え付けることで文明を崩壊寸前へと追い込んだ。 そんな世界を救ったのは、一人の少女が奏でた「歌」。 歌の力でNoiseを打ち消す少女たちは、いつしか【魔奏少女】と呼ばれ、人々の希望となっていく。 ――それから100年後。 幼い頃、魔奏少女に救われた少女・識戸ミソラは、「世界一の魔奏少女になる」という夢を胸に、私立姫嶋学園魔奏少女育成コースへ入学する。 しかし、彼女には致命的な欠点があった。 誰よりも強い心奏力を持ちながら、すべての楽器への適性がゼロだったのだ。 「魔奏少女にはなれない。」 そう諦めかけていたある日、学園を襲った巨大Noiseとの戦いの中で、誰にも扱えなかった伝説の魔奏器《ルナ》がミソラを選ぶ。 歌で世界を救う少女たちの青春、ライブ、そして戦い。 これは、一人の少女が夢を追い続け、その歌で世界を変えていく物語。