女子校に間違えて入学してしまった理系男子の僕、伊藤翼 。なんとか「イケメン女子」として1年間をやり過ごし、無事に2年生へと進級した 。 しかし、平和な学園生活に特大のバグが襲いかかる。新学期から、全生徒にスマート・リストバンドの装着が義務付けられ、最新AI『SEIRAN-Health』による24時間体制の生体データ監視が始まってしまったのだ！ 男の力強い脈拍や骨格のデータがAIにバレたら、ホルモン異常とみなされて即強制退学（ゲームオーバー） 。 僕は天才ハッカーの水無瀬透子と共謀し、自らの生体データを「標準的な女子」に偽装するパッチを開発して対抗する 。 だが、ポンコツAIの欠陥（サンプリングバイアス）による後輩部員の不当な部活停止処分 や、学園に潜伏する僕と骨格が89％一致する「見えない侵入者（ゴースト）」の暗躍など 、新たなトラブルが次々と巻き起こる。 さらに、慕ってくる後輩女子たちからの過剰なスキンシップで、僕の心拍数（男としての動揺）は常に限界突破寸前で……！？ 人間工学と物理法則を武器に、学園のバグを修正する「理系探偵」のバイオメトリクス・サスペンス＆学園コメディ、第3部開幕！