千年前、突如として魔物やその高位の存在である魔人、そしてそれらの住処とされるダンジョンが世界各地に出現する。同時にダンジョンから急激に漏れ出た魔力の影響を受け、人類の９割は魔法を使えるようになった。これにより人類はダンジョンに挑むための攻略者（プレイヤー）となり、プレイヤーたちによって結成されるクラン（企業、学校）が急増していく。ダンジョンや魔物、魔人がなぜ急に現れたのか、これらは一体なんなのか、解明されないまま人類は絶滅の窮地に立たされて・・・。 そして現代、主人公夏向（かなた）は私立桜花高等学園の生徒会のクランに所属し、仲間と共にダンジョン攻略に挑み、いずれはこの世界の真実を知ることになる。