高校の学園祭を機に佐伯遥を意識し始めた高山茂は、大学受験時の初詣で彼女の神秘的な一面に触れる。京都での大学進学後に再会し恋人のような関係になるが、遥は古代史への傾倒と謎の体調不良の末、奈良の纒向付近で突如失踪してしまう。 彼女の面影を追うように考古学者となった茂は20年後、纒向の発掘調査に主任として携わる。難航する現場で当時と変わらぬ遥の幻影を目撃し、その導きによって貴重な祭祀遺構と割れた青銅鏡を発見する。遥が近くにいると確信した茂は、彼女のその後の消息を本格的に調べ始める。