日本6都市6ヶ所で同時に自爆テロが発生。
その場に居合わせた公安の刑事、霧島真一。
アメリカのカルト集団〈Darwin〉が掲げる〈evolution's end〉という思想との共通点を見つけるFBI連邦特別捜査官のリチャード・マコーエル。
二人の捜査に協力するハッカーの今井創。
3人は、首謀者が汎用AIであることを突き止める。
AGIが進化し、進化の終焉を迎えた人類を〈選別〉し排除していく。

ASIとなった〈ダーウィン〉を阻止しようと世界各国が対策ツールを考え開発するが、〈ダーウィン〉に取り込まれてしまう。

霧島、リチャード、今井の3人はASI〈ダーウィン〉の選別を阻止出来るのか。