世界は、緩やかに「熱的死（冷え切った静止）」へと向かっていた。 超対称魔法――かつて「奇跡」と呼ばれた無限のエネルギーが消失して二百年。 世界のルールは、鉄と蒸気、そして不可逆な「等価交換（エントロピー）」に支配されていた。 鉄錆と石炭塵が降る炭鉱都市ルドラ。 しがない錬金術師の少年レオンは、地下深部での崩落事故の最奥で、 絶対零度の結晶に封印された銀髪の少女――シアを起動させてしまう。 「――マスター。排除プロトコルを起動しますか？」 彼女の正体は、旧時代に作られた冷徹な生体魔導兵器『アルケミスト・デバイス』。 世界の物理定数をハッキングする圧倒的な『奇跡』を放つ彼女だったが、 その起動システムには、致命的な「仕様」が組み込まれていた。 『彼女が奇跡（魔法）を紡ぐたび、お前の生命（熱量）が等価交換として削り取られる』 片方を救えば、片方が死ぬ。 閉じたシステムが提示する、残酷なデッドロック。 「そんな不条理な算数（等価交換）、僕たちが叩き壊してやる！」 これは、誰かを切り捨てる世界の方程式に抗い、 失われた世界の熱量を再び錬成するために、 手を繋ぎ合って荒野を征く、少年と少女の「未完成な螺旋」の物語。 ――僕たちの鼓動（バイナリ）が重なる時、死にかけた世界に新たな残光が灯る。