仮想西暦2037年、暗殺稼業『始末屋』の一員だったレンは、標的となった少女を見逃したことで、己が師匠と決裂。少女を守るため、相打ちとなりながら高台から身を投げた。 ところが、死を覚悟した彼が着地したのは、見知らぬ路地裏。それもヒトではない異形が屯する街の中だった。 通りがかった老警官モンド・ミッドヴィレッジに保護されたレンは、25年前の異変を期に魔境と化した異世界の都市『ニューダーク市マンハンタン』に迷い込んだのだと知る。 モンドの助力により、『表』の住民として第二の人生を始めたレン。しかし、そんな彼の周囲では、暗殺集団『3番街のイレイザー』の噂が囁かれており・・・。 怪物にされた少女、不死身の闇医者、悪を許さぬ警官、そして異世界から来た青年。 深夜の廃教会に集いし彼らは、悪でもって悪を誅す！