人生に疲れた人間は、 なぜか午前3時にコンビニへ向かう。 誰にも言えない孤独を抱えた23歳の会社員・藤崎和也も、その一人だった。 だがある夜、いつものコンビニは「午前三時商店」という奇妙な店へ変わっていた。 そこは、眠れない人、後悔を抱えた人、 居場所を失った人だけが辿り着ける場所。 深夜の街の片隅で、孤独な人々が少しだけ救われていく。