文明が海に沈んで、二千年。 旧人類の少年カイルは、小さな島で母と妹と共に暮らしていた。 海で魚を獲り、島の人々と分け合い、妹の歌を聴く。 豊かではない。安全でもない。 それでも、その島には確かに幸せな日々があった。 だがある日、島の沖に不審な船団が現れる。 それは、穏やかな日常が終わる前触れだった。 沈んだ文明の残骸が眠る海。 この星の頂点に立つ新人類アクアノイド。 そして、海の上に残された楽園――エデンの伝説。 旧人類の少年カイルは、まだ見ぬ海へと漕ぎ出していく。 少年の航海が、沈んだ星の運命を動かし始める。