人生の選択に絶望した者や、重大な岐路に立つ者だけが、午前2時と3時の間の「存在しない時間」に迷い込む不思議な駅――『薄明駅（ステーション・トワイライト）』。 そこは、現世で何かを「落としてきた」人々が、次の行き先を決めるために一時滞在する場所だった。駅員として働く青年・カナタ（彼もまた記憶の一部を失っている）は、乗客たちが抱える「未練」や「人生のボタンの掛け違い」を紐解き、彼らが再び自分の足で現実の列車に乗る手助けをしていく。