サイラス帝国の作り出した、生物兵器ガルディオンNO.046。 ラルクーザ王国の猛攻により、最大の武器である「毒」を失ってしまう。 NO.046が行き着いた先は、あまりにものどかな辺境の国、イグリス共和国だった。 そこで出会ったのは、悲しみを抱える少女達。 NO.046は初めて触れる世界に戸惑い、普通の生活というささやかな願いを抱き始める。 しかし、連絡の途絶えた生物兵器を回収すべく、帝国の調査部隊の影がじわじわと迫りつつあった。