主人公、水上真樹也は、自称「少数派」。 爬虫類好きで、人とも少し容姿も違う。 学校で自分を受け入れられず、将来にも関心がない。 そんな真樹也に、海外の学校への「交換留学」の案内が届く。 留学先の先生、火村の誘いに乗ってやってきた留学先は、 ドラゴンと人間がともに暮らす、異世界の国『エンドレイク王国』だった。 真樹也は龍使いになるための学校「龍学校」の学生となり、 仲間と共に学園生活を送り、龍についての様々な知恵を身に着ける。 そんな真樹也と、エンドレイク王国に、魔の手が忍び寄って来る。 真樹也は相棒のドラゴン、ニコとともに、様々な困難に立ち向かう！