人類初の宇宙魔導船ドラゴンフライが航海試験中に火災事故を起こした。乗り組んでいた魔女三人は船を捨てるか事態収拾するか決断を迫られる。脱出期限が近付くなか船長を除く二人が反乱を起こし隠されていた陰謀が露呈していく