幼い頃から見えていた“何か”を、黒縁メガネで封じてきた高校生・狭間零（はざま れい）。 都内の全寮制高校で平凡な毎日を送っていた零は、ある日、幼馴染の藤原時綱に無理やりオカルト研究会へ連れ込まれる。 そこで出会ったひとつ上の先輩・白峰麗華に、神隠しの話を聞かされた直後——いつものようにふざけ合った拍子にメガネが壊れ、急遽新しいメガネに替えたその夜から、零の視界は狂い始めた。 白い霧。歪む鳥居。遠くから聞こえる少女の声。「げて……逃げて零っ！！」そして、祖父によって封じられていた記憶が、断片的に蘇る。 実は自分には2つ上の姉・美月がいて、8年前に幽境村で神隠しに遭っていたこと。 そして、自分の左目が“幽境の狭間”——古代と現代が溶け合う異界——を視ることができるという、恐ろしい真実。夏休み、麗華主催の「遠野心霊ツアー」に乗って故郷・幽境村へ帰った零は、ついに本物の神隠しに遭う。狭間の中で出会った平安時代の巫女・櫻姫は告げる。 「お前は幼い頃から、この世界を視えていた」と。零刻の力——時間を“零”に留め、“刻”む力——が覚醒した時、零の運命は動き出す。失われた姉。 影のように零を誘う敵・影桜。 そして、時綱が隠し続けていた真実。過去と現在が折り重なる狭間で、零は問われる。 「お前は、視えてしまったものを、どこまで受け入れる？」静かな日常が崩れ、零の左目に映る白い霧は、ますます濃くなっていく——。