遠い昔、遥か彼方の銀河系で…218ABY(ヤヴィンの戦いから218年後)、主人公のジェダイ マスター　フェーン・スカイウォーカーは高祖父(祖父の祖父)のルークスカイウォーカーが銀河に残した痕跡などを新共和国の管轄外まで足を踏み入れて捜索していた。とある辺境の星、ケマティアンに訪れて高祖父の痕跡を探していたらとある古い銀河帝国時代の船の残骸やらがいろいろと重なったりしてできた遺跡を見つける。そこでその遺跡に入ってみると一歩足を踏み入れた途端闇のフォース、ダークサイドの力を感じた。さぁ、遺跡の中にはいったい誰がいたのか。フェーンは一体どうなってしまうのか。