人間が異能力を扱うようになってから早十年。当初は困惑していた社会も、様々な領域で異能を扱うようになった。そうした社会の動きの中で政府が打ち出した政策。 　それは『特別保護制度』。政府が有用だと判断した異能力者を保護施設内へと収容し、その能力を全力で活かすための制度だ。 　しかし強制的に施設へと収容されることに対して不満を抱いた国民たちは、施設内から脱走した者たちを集い、裏社会を形成。そんな裏社会の人間たちでまた収容された人間を救い出すという循環が出来ていた。 　そんな『拉致依頼』を受けた裏社会の何でも屋、またの名を瞬間導航者《フラッシュナビゲーター》を生業とする主人公、慧。 　慧は依頼をこなすために相棒の網谷凜華と共に、特別保護対象者を拉致するのだが…… 　まさかそれが、対象者内でも上位0.001パーセントに君臨する『Sランク』特別保護対象者であるとは知るよしも無かった。 　そしてその出会いをきっかけに、様々な物語が動き出す……！