安政三年、コレラが吹き荒れる長崎に、ある「怪物」が覚醒した。元オランダ通詞の跡取り・葛城理一郎。 その肉体に宿るのは、現代地球の科学・数学・物理学の頂点を極めた天才の魂だった。 彼にとって「尊王攘夷」も「佐幕」も、人間が作った脆い砂上の楼閣、ただの不確定因子（ノイズ）に過ぎない。 「世界を進歩させるのは、思想ではない。 科学と資本だ」実家の親すら騙し討ちで最初の手駒にし、前世の薬学知識で「命の価格を支配する特効薬」を密造。 偽薬業者や産業スパイには、一切の慈悲なく化学薬品による人体実験と消去で報復する。 坂本龍馬、西郷隆盛、新選組……歴史の英雄たちが「大義」に命を燃やす横で、すべてを数式で管理し、敵を幾何学的に間引く理一郎。 新政府も旧幕府も、欧米列強の巨大資本すらもチェスの駒として使い潰し、国家の財政を人質に取る「絶対無比の財閥」を築き上げる、冷徹なる理系ピカレスクロマン、開幕。