未知の集合生命体《CHORUS》により、人類は要塞都市へ追い込まれていた。

FRAME兵養成校に通う孤独な少年・天音海斗は、学園襲撃の中で、灰色のFRAMEをまとった女兵士に救われる。

彼女が最後に残した言葉は、

「化け物になってでも、生きろ」

その言葉通り、海斗は生き延びた。

しかし、目覚めた彼の身体は異常な再生能力と力を宿し、救助に来た兵士たちから“人間ではないもの”として銃口を向けられる。

処分保留となった海斗は、監視下のまま第七要塞都市中央戦術学園へ移される。

人間か、怪物か。

孤独だった少年は、戦場と学園の中で仲間と出会いながら、自分がまだ人間でいられるのかを問い続ける。