現代日本。AIと機械化技術が発展した時代、人間はAIを支配するため、人間自身を一時的に機械化する人工機械化システム――AMSを生み出した。 大野春太は、AMロイドの火災事件で両親を失い、双子の妹・秋音を庇って重傷を負う。死にかけた春太を救ったのは、AMSの第一人者である天才科学者・出雲孔雀だった。 だが、目覚めた春太は、体内にAMSコアを宿した規格外の美少女AMロイド――大原春奈として生まれ変わっていた。 しかも今の春奈は、世間ではカリスマモデル。学園では今どきギャル。裏では孔雀の助手。そして正体は、妹を溺愛する元兄。 春奈は、海上浮島型の全寮制学園都市・天機学園へ入学し、火災以来会えなかった秋音と再会する。 しかし秋音は、兄を失ったショックで感情を閉ざし、火災事件の真相と復讐を求めて学園へ来ていた。 妹に正体を明かせない春奈。 春奈に兄の面影を感じてしまう秋音。 そして、二人の過去に関わるAI暴走事件の影。 これは、人間とAI、機械と心、喪失と再会をめぐる、近未来TS学園メカバトル。