八月三十一日の深夜零時。 海沿いの無人駅「海鳴り駅」には、“人生でいちばん後悔した夏”へ戻れる列車が現れるという。 幼なじみを亡くした後悔を抱えた高校生・神崎悠真は、どこか不思議な転校生、篠宮透花と出会う。