西暦2148年。 未知粒子《XENO》によって、 人類は“進化”を始めた。 超常能力を得た新人類《XENOVA》。 進化できなかった旧人類《ORIGIN》。 世界は二つに分かれ、 史上最大の進化戦争が始まる。 能力を持たないはずだった少年、 黒瀬ユウ。 だが彼は、 全XENOVAの起源―― 《原初因子》の適合者だった。 進化した者だけが生き残る世界。 神になるか。 人間でいるか。 その選択が、 人類の未来を決める。 これは、 “進化”に抗った、 最後の人類の物語。