「不浄」こそが日常。中世の衛生概念を極限まで改悪したような異世界に、九条アヤトはクラスごと召喚された。 周囲に広がるのは、下水と腐敗臭が漂い、疫病が蔓延する絶望的なスラム。クラスメイトが派手な火力を誇る「聖騎士」や「魔術師」の加護に沸く中、アヤトに与えられたのは、一切の汚れを無効化する不遇スキル『清潔（クリーン）』だった。 しかし、魔法で魔物を倒せても、不衛生がもたらす病と悪臭からは逃げられない。聖騎士の鎧は錆び、美少女たちの肌は荒れ果てていく。そんな中、アヤトはスキルを駆使して「滅菌・脱臭・浄水」を完璧にこなし、異世界に唯一無二の「究極のマイホーム」を建設する。 「お願いアヤト君、ここに入れて……！」 泥にまみれ、異臭に耐えかねたかつてのカースト上位者たちが、現代日本並みの清潔さを求めてアヤトの玄関に泣きついてくる。バグった世界の不潔をデバッグし、快適な引きこもり生活を勝ち取る異世界逆転劇。